Pada umumnya, penyimpanan sekunder berbentuk disk magnetik. Kecepatan pengaksesan memori sekunder ini jauh lebih lambat dibandingkan memori utama. Pada bagian ini akan diperkenalkan konsep-konsep yang berhubungan dengan memori sekunder seperti sistem berkas, atribut dan operasi sistem berkas, struktur direktori, atribut dan operasi struktur direktori, sistem berkas jaringan, sistem berkas virtual, sistem berkas GNU/Linux, keamanan sistem berkas, FHS (File Hierarchy System), serta alokas blok sistem berkas.